一、gzip解壓NR庫的時(shí)候，報(bào)錯(cuò)格式違法的解決方法
1、檢查NR庫文件是否下載正確
NR 庫文件應(yīng)該是 gz 格式的，如果文件格式不正確，會(huì)導(dǎo)致解壓失敗。檢查一下下載的 NR 庫文件是否正確。如果不正確，嘗試重新下載。
2、使用工具比對(duì)文件校驗(yàn)和值是否相同
文件在傳輸或下載過程中可能會(huì)發(fā)生損壞，也可能導(dǎo)致解壓失敗。嘗試重新下載 NR 庫文件，或者下載同樣的文件來比較校驗(yàn)結(jié)果。在下載 NR 庫文件之后，可以使用 MD5 校驗(yàn)和工具或 SHA1 校驗(yàn)和工具來比對(duì)文件校驗(yàn)和值是否相同。
3、確認(rèn)解壓命令的正確性
如果下載的 NR 庫文件沒有問題，則應(yīng)該確認(rèn)解壓命令的正確性。在解壓命令中指定正確的參數(shù)，例如 “-d” 告訴 gzip 解壓縮源文件并將解壓縮的文件放入目標(biāo)目錄中。
二、Linux gzip命令
1、簡(jiǎn)介
Linux gzip命令用于壓縮文件。gzip是個(gè)使用廣泛的壓縮程序，文件經(jīng)它壓縮過后，其名稱后面會(huì)多出”.gz”的擴(kuò)展名。
2、語法
gzip [-acdfhlLnNqrtvV][-S <壓縮字尾字符串>][-<壓縮效率>][--best/fast][文件...] 或 gzip [-acdfhlLnNqrtvV][-S <壓縮字尾字符串>][-<壓縮效率>][--best/fast][目錄]
參數(shù)：
-a或–ascii：使用ASCII文字模式。-c或–stdout或–to-stdout：把壓縮后的文件輸出到標(biāo)準(zhǔn)輸出設(shè)備，不去更動(dòng)原始文件。-d或–decompress或—-uncompress：解開壓縮文件。-f或–force：強(qiáng)行壓縮文件。不理會(huì)文件名稱或硬連接是否存在以及該文件是否為符號(hào)連接。-h或–help：在線幫助。-l或–list：列出壓縮文件的相關(guān)信息。-L或–license：顯示版本與版權(quán)信息。-n或–no-name：壓縮文件時(shí)，不保存原來的文件名稱及時(shí)間戳記。-N或–name：壓縮文件時(shí)，保存原來的文件名稱及時(shí)間戳記。-q或–quiet：不顯示警告信息。-r或–recursive：遞歸處理，將指定目錄下的所有文件及子目錄一并處理。-S<壓縮字尾字符串>或—-suffix<壓縮字尾字符串>：更改壓縮字尾字符串。-t或–test：測(cè)試壓縮文件是否正確無誤。-v或–verbose：顯示指令執(zhí)行過程。-V或–version：顯示版本信息。-<壓縮效率>：壓縮效率是一個(gè)介于1－9的數(shù)值，預(yù)設(shè)值為”6″，指定愈大的數(shù)值，壓縮效率就會(huì)愈高。–best：此參數(shù)的效果和指定”-9″參數(shù)相同。–fast：此參數(shù)的效果和指定”-1″參數(shù)相同。3、實(shí)例
壓縮文件：
[root@runoob.com a]# ls //顯示當(dāng)前目錄文件a.c b.h d.cpp[root@runoob.com a]# gzip * //壓縮目錄下的所有文件[root@runoob.com a]# ls //顯示當(dāng)前目錄文件a.c.gz????b.h.gz????d.cpp.gz[root@runoob.com a]#
接范例1，列出詳細(xì)的信息：
[root@runoob.com a]# gzip -dv * //解壓文件，并列出詳細(xì)信息a.c.gz:???? 0.0% -- replaced with a.cb.h.gz:???? 0.0% -- replaced with b.hd.cpp.gz:???? 0.0% -- replaced with d.cpp[root@runoob.com a]#
接范例1，顯示壓縮文件的信息：
[root@runoob.com a]# gzip -l * compressed uncompressed ratio uncompressed_name 24 0 0.0% a.c 24 0 0.0% b.h 26 0 0.0% d.cpp
延伸閱讀1：NR庫是什么
NR(Non-Redundant Protein Sequence Database)非冗余蛋白庫，所有GenBank+EMBL+DDBJ+PDB中的非冗余蛋白序列，對(duì)于所有已知的或可能的編碼序列，NR記錄中都給出了相應(yīng)的氨基酸序列（通過已知或可能的讀碼框推斷而來）以及專門蛋白數(shù)據(jù)庫中的序列號(hào)。NR庫相當(dāng)于一個(gè)以核酸序列為基礎(chǔ)的交叉索引，將核酸數(shù)據(jù)和蛋白數(shù)據(jù)聯(lián)系起來。
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