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KEGG 怎么用?

來源：千鋒教育
發(fā)布人：xqq
時(shí)間： 2023-10-13 03:13:12 1697137992

一、KEGG的用法

KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）是一個(gè)廣泛使用的生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫，提供了關(guān)于基因、代謝通路、疾病等生物信息的豐富資源。

1、訪問KEGG網(wǎng)站

打開KEGG的網(wǎng)站

2、數(shù)據(jù)查詢

基因查詢：在網(wǎng)站的搜索框中輸入基因名、基因ID或其他相關(guān)信息，點(diǎn)擊”Search”進(jìn)行基因的搜索。KEGG提供了豐富的基因相關(guān)信息，如基因功能、通路關(guān)聯(lián)等。通路查詢：在網(wǎng)站的搜索框中輸入通路名或通路ID，點(diǎn)擊”Search”進(jìn)行通路的搜索。KEGG提供了詳細(xì)的代謝通路和信號(hào)傳導(dǎo)通路信息，包括圖形展示和相關(guān)基因、化合物的關(guān)聯(lián)。

3、數(shù)據(jù)瀏覽

瀏覽查詢結(jié)果，查看基因、通路或其他相關(guān)信息的詳細(xì)頁面。KEGG提供了圖形展示、注釋、參考文獻(xiàn)等相關(guān)信息，以及與其他數(shù)據(jù)庫的鏈接。

4、數(shù)據(jù)分析

根據(jù)需要，可以進(jìn)一步分析和解釋KEGG提供的數(shù)據(jù)。例如，可以將查詢的基因列表導(dǎo)入到生物信息學(xué)工具中進(jìn)行富集分析、通路分析等。

5、API訪問

KEGG還提供了API（Application Programming Interface），可以通過API訪問KEGG的數(shù)據(jù)和功能。開發(fā)人員可以使用API來獲取特定數(shù)據(jù)、進(jìn)行數(shù)據(jù)集成和自動(dòng)化分析等。

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2023-10-13 04:12:45
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